Find. Extract. Predict.

Tap into a treasure trove and jump start your research … OntoChem’s text mining, natural language processing and semantic data extraction technologies will make the most of all the internal and external data sources available.

We can help you to extract information from unstructured and structured data and to turn it into knowledge for research and discovery as well as for decision-making. 

Let’s talk about what you need and expect from your data!

Ontochem GMBH

We are a highly dedicated multidisciplinary team with various backgrounds in big data,  knowledge extraction and IT as well as pharmacy, chemistry, biochemistry, and biology.

We are on a mission to make not only your content, but all the world’s scientific and  IP-relevant content semantically discoverable and therefore ever more valuable for all  of our life and material science customers.

We strive to support you with the most useful tools for knowledge discovery possible,  to offer you ever-increasing numbers of data sources, to constantly optimize our  ontologies and to perfect our proprietary, high-throughput semantic document  processing and annotation pipelines.

Learn more about our team ​here​.

We offer high performance and highly customizable text analysis and data mining  products that can be tailored to meet the specific needs of every client.  Relying on over 14 years of expertise, we can rely on our innovative technologies to  offer you large-scale and future-proof solutions that will maximize the value of your  content.

Our information discovery tools are used by small and large life and material science  companies to find information by automatically indexing and analyzing internal as well  as external data collections.   Since what we do will never fit on a website, why don’t you just call us. Let’s talk about  what we can do for you!

We are very proud to work with some of the most influential companies in the fields of  pharma, chemistry, speciality chemistry, material science, publishing and IT.

Semantic Solutions

SciWalker

SciWalker is an easy-to-use semantic search tool built by scientists for scientists, to enable sophisticated concept-based queries, combined with traditional text searching.

Developed for the life and material science communities, SciWalker delivers precise answers to complex questions, such as “​Which tetrazole containing compounds have been used in clinical trials?”

Quickly processing more than 1 billion knowledge facts from text sources like PMC/Medline and clinical trials, as well as databases like ChEMBL, full-text document search and concepts from more than 20 knowledge domains, SciWalker accelerates knowledge discovery.

OntoChem Processor

OntoChem Processor is a highly customizable, easy-to-use, standalone document normalization and annotation pipeline.

Use it for blazingly fast annotation of confidential documents locally (no internet connection needed) and complete control over the annotation and knowledge extraction process.

The processor tool will quickly annotate the text with identified ontological terms and categories, instantly surfacing connected terms and concepts for fast information discovery.

OntoChem Ontologies

OntoChem Ontologies provide a range of ontologies for specific medical and biochemical applications – such as Anatomy, Antibodies, Cell lines or Chemistry.

Advanced, yet simple. Our ontologies manage complex facts from any knowledge domain with extreme efficiency, but they’re also easy to use and apply as they do not require any pre-defined data schema and so can be integrated with any in-house search capabilities.

Custom Services

We cover the entire range of services needed for data mining and knowledge  extraction from the downloading and normalization or sources, the provisioning of data  streams, the building and optimization of ontologies, the development of ontology  editors and the annotation pipeline itself, the knowledge extraction and the storing of  extracted information, up to the development of graphical user interfaces.

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Custom Services

We cover the entire range of services needed for data mining and knowledge  extraction from the downloading and normalization or sources, the provisioning of data  streams, the building and optimization of ontologies, the development of ontology  editors and the annotation pipeline itself, the knowledge extraction and the storing of  extracted information, up to the development of graphical user interfaces.

Semantic Driven Products

What Sciwalker Studio is?

SciWalker Studio is a customizable text annotation tool which allows you to annotate your own documents and facilitate your approach of reading, understanding, classifying and analyzing your texts of interest. You can use OntoChem’s ontologies or add your own vocabulary.

Further you can build NLP and ontology supported pattern to extract data out of your document collections, classify texts by the extracted data or apply metrics. Click the link below and request a Sciwalker Studio application.

https://wkf.ms/48wSt36

Blog

Summarized from the article authored by Hélène Draux, Mihai Gherghe, and Juergen Wastl. The shift towards sustainable chemistry has highlighted the relevance of ionic liquids (ILs) as an area of interest. These non-flammable, low-volatility solvents allow precise property optimization to enhance reactions and enable recycling while reducing waste. However, identifying the optimal ion combination involves consolidating knowledge fragments from across multiple documents and fields. This is where a powerful specialist tool such as SciWalker, part of OntoChem’s suite of chemical and life sci...   read more

   

An in-depth look at the OC Processor.

By Mihai Gherghe and Misha Kidambi. In 2006, mathematician and data scientist Clive Humby gave a talk at a conference where he reported...

An in-depth look at the OC Processor. By Mihai Gherghe and Misha Kidambi. In 2006, mathematician and data scientist Clive Humby gave a talk at a conference where he reportedly used the phrase “data is the new oil. Today, over a decade later, the statement holds its ground and is, in fact, more valid than it ever was. Stretching the metaphor of comparing raw data to raw oil is apt—both are not very useful until they are processed. Refining and processing data is a challenge for companies that have to manage and work on extensive knowledge databases. Navigating external information has ...   read more

   

Pharmaceutical industry to benefit from the strategic acquisition. 

Pharmaceutical industry to benefit from the strategic acquisition.  OntoChem GmbH has now been acquired by Digital Science, further cementing the partnership between the two companies. OntoChem’s semantic indexing capabilities have been driving one of Digital Science’s product platforms, Dimensions Life Sciences & Chemistry, since 2021.  Recognizing the importance of the partnership to the industry, Christian Herzog, Chief Product Officer for Digital Science and co-Founder of Dimensions, explains: “OntoChem is a strong strategic fit for Digital Science, in combination with our fl...   read more

   

OntoChem has contibuted a presentation on its efforts to identify and extract novel biomarkers to the 9th Annual Scientific Computing Days of the FDA. this talk was part of the "Chemoiformatics ...

OntoChem has contibuted a presentation on its efforts to identify and extract novel biomarkers to the 9th Annual Scientific Computing Days of the FDA. this talk was part of the "Chemoiformatics for One Health" breakout session. Ee described our semantic technologies to extract biomarker information from unstructured text such as patents, scientific articles or conference reports and abstracts as well as normalizing data from databases such as ClinVar, COSMIC, GWAS and OMIM. More than 39 million biomarker datasets have been extracted. Analysis of this dataset is accessible via Google's...   read more

   

OntoChem is now indexing >400 million public documents with semantic ontology concepts from over 35 knowledge domains using FAIR concept identifiers. For example, an ontology concept identifier ...

OntoChem is now indexing >400 million public documents with semantic ontology concepts from over 35 knowledge domains using FAIR concept identifiers. For example, an ontology concept identifier (OCID) is assigned to each chemical compound, reaction, species, disease or protein term (https://registry.identifiers.org/registry/ocid). Beyond indexing, small molecules, sequences and reactions are registered and made publicly available in Google’s BigQuery “SciWalker Open Data” dataset with a daily update. So far, OntoChem’s compound registry on BigQuery contains 137 million unique chemical st...   read more

News

Contact details

OntoChem GmbH (main office)
Blücherstrasse 24
06120 Halle (Saale)
Germany

email: info@ontochem.com
phone: +49-345-570296-11

About Us

Lutz Weber

medicinal chemist<br /> CEO
Graduated in Budapest and Leipzig. Founded the OntoChem GmbH in 2005. Holds the national record for the most commutes between Stuttgart and Halle

Felix Berthelmann

microbiologist<br /> COO
Has a PhD in microbiology. Manages projects and is responsible for customer relations.
Can’t ever say no to taking a good photo.

Adnan Ali

material scientist<br /> ontology development
QAs and corrects OntoChem’s ontologies with a main focus on the chemistry ontology.
Never say no to sweets.

Rabiya Arshad

computer scientist<br /> software tester
Automatic and manual testing of graphical user interface (GUI).
Having a talent to walk on the edge.

Arya Anil

material scientist<br /> relation extraction
Improving the relation extraction by analysing the results and maintaining the ontologies.

Claudia Bobach

pharmacologist<br /> pharmacology & ontology development
Holds a PhD in pharmacology. Manages all ontologies and oversees knowledge extraction projects. Makes an art out of chocolate eating.

Timo Böhme

computer scientist<br /> system architecture
Main system architect and brain behind basically all of OntoChem’s technologies.
Blazingly fast biker you will never be able to overtake.

Zofia Dziuganowska

project manager
Holds a PhD in biotechnology and chemistry. Managing the Ontochem Projects.
Explores the surrounding and infused with enough energy to kickstart the day with a lively dance.

Iryna Feuerstein

software developer<br /> backend development
Responsible for optimisation of backend systems.
Math enthusiast and book lover. If I hit the lottery, catch me sipping tea in a library and turning pages to unravel the mysteries of the world.

Matthias Irmer

computational linguist<br /> knowledge extraction
PhD in natural language semantics. Knowledge extraction specialist.
Drives the development of OC|processor forward. Never short of a witty quip.

Barnabas Shadrack Jabes

cheminformatician<br /> chemistry database curator
Responsible for compound classification as well as OntoChem's compound and reaction ontologies.
Has a contingency plan for everything.

Aleksei Krasnov

cheminformatician<br /> chemistry database curator
Responsible for compound classification as well as OntoChem's compound and reaction ontologies.

Yves König

bioinformatician<br /> content development
Responsible for OntoChem’s middlewares that mediate between the various front- and backend services.

Ulf Laube

chemist<br /> databases IT structure
Responsible for source collection and normalization as well as the IT infrastructure.
Knows only two states: work or travelling abroad.

Joachim Ludwig

bioinformatician<br /> frontend development
Develops and maintains OntoChem’s frontends.
Knows more about Whiskey than the average scotsman.

Adrian Nuradiansyah

computer scientist<br /> ontology engineer
PhD in Knowledge representation and reasoning. Managing and (re)building ontologies as well as streamlining the ontology building process.
Learn driving by watching formula-1 races.

Olga Nikitina

computational linguist<br /> Java NLP Engineer
Determined to train language models to retrieve every bit of knowledge from scientific texts.

Anett Püschel

bioinformatician<br /> frontend development
Responsible for OntoChem’s various frontends and our ontology editing tools.
Can find the perfect color for a GUI element with her eyes closed.

Christoph Ruttkies

bioinformatician<br /> middleware development
Responsible for OntoChem’s middlewares that mediate between the various front- and backend services.
Plays field hockey, mostly outside the office.

Nilushiya Sarveson

material scientist<br /> ontology development
QAs and corrects OntoChem’s ontologies.
Makes everyone envious of her self-cooked lunch marvels all the time.

Jennifer Szczesny

bioinformaticion<br /> data normalization
Responsible for normalization of clinical trials information and other data sources. Ontochem’s sportiest bioinformation scientist.

Our Partners

We have established a number of collaborations with academic institutions, IT- and  biotechnology companies as well as content providers to fully leverage and further our  product portfolio. The knowledge of the following partners is captured in OntoChem’s  reaction and knowledge databases, our chemical ontology toolboxes and all our other  software applications. We are proud to be able to collaborate with …

Publications
Job Offers
AGB
Legal Disclosure

Miscellaneous

Our Ontologies

Our Services

Technical Documentation

OC|processor Annotation Modules For Named Entity Recognition
549.0 KiB

Talks and Presentations

Download the PDF from the talk we gave at the 254th ACS National Meeting & Exposition August 2017 in Washington:

Ontologies

Download an example ontology showcasing our chemical compound classes.

513.5 KiB

SARminer Gold Corpus

We present the SARminer Gold Corpus, a gold standard for chemistry-disease relations in patent texts. The corpus consists of excerpts from US patent applications and includes annotations of named entities of the domains chemistry (e.g. “propranolol”) and diseases (e.g. “hypertension”) as well as of related domains like methods and substances. Also, domain-relevant relations between these entities, e.g. “propranolol treats hypertension”, have been manually annotated. The corpus is attempted to be suitable for developing and evaluating relation extraction methods. The corpus is available in the BRAT standoff annotation format. Details on the creation of the corpus can be found in the following publication:

Schlaf, Antje, Claudia Bobach, and Matthias Irmer (2014): Creating a Gold Standard Corpus for the Extraction of Chemistry-Disease Relations from Patent Texts. In Nicoletta Calzolari et al., editors: Proceedings of the Ninth International Conference on Language Resources and Evaluation (LREC’14), Reykjavik, Iceland. European Language Resources Association (ELRA).| (PDF)

This work is distributed under the Creative Commons license. Any licensee shall acknowledge use of the corpus in all publications of research based in whole or in part on its use through citation of the above publication.

For creating this corpus, we randomly selected 21 US patent applications from 2010 which contained a claimed SAR relation. We annotated named entities in these documents with OCMiner and selected all of those sentences which contained both a chemistry as well as a disease term, resulting in a total of 365 sentences. This co-occurrence based selection method provides a first approximation to the maximal recall of chemistry-disease relations expressed in the text. Please note that relations that are expressed by more than one sentence were not considered for the SARminer Gold 1 corpus (but see SARminer Claim Sections below). Subsequently, sentences were manually annotated with the help of the open-source tool BRAT. The manual annotation process included the correction of erroneous automatic named entity annotations (which lead to a reduction of the number of sentences which actually bear a chemistry-disease co-occurrence from 365 to 270), the addition of missing named entities from the relevant domains, as well as the annotation of relations between named entitities. Additionally, we applied chain reasoning, a method for automatically inferring additional relations via relation chains, and integrated these relations into the corpus. Size: 270 sentences from patent texts (both from description and from claim sections), exhaustively annotated with named entities and relevant relations between them. Source: 21 US patent applications from 2010 containing a claimed SAR relation.
364.1 KiB
From chemistry-related US patent applications from 2010 (approx. 43,000 from approx. 340,000 in total), we selected those patent claims (approx. 22,000) which contained co-occurrences of chemistry and disease terms. Of these claim sentences, we randomly chose 1,000 and randomized them. The annotation was performed in the same way as in SARminer Gold Corpus 1, with the difference that SARminer Gold Corpus 2 contains only sentences from patent claims, and the annotated sentences originate from a much bigger number of randomly selected patent applications. Size: 1,094 patent claims exhaustively annotated with named entities and relevant relations between them. Source: Automatic selection and randomization of claims from US patent applications from 2010.
2.4 MiB
The claim sections of the patent application chosen for SARminer Gold Corpus 1 have been annotated with named entities and relevant relations between them. Additionally, relations between named entities in different patent claims have been annotated, including anaphoric relations (coreference). Size: Entire claim sections of 21 patent applications, annotated with named entities and relevant relations between them, both within a claim and in different claims. Source: Same patent sources as SARminer Gold 1.
492.2 KiB

Our Publications

Saber A Akhondi, Hinnerk Rey, Markus Schwörer, Michael Maier, John Toomey, Heike Nau, Gabriele Ilchmann, Mark Sheehan, Matthias Irmer, Claudia Bobach, Marius Doornenbal, Michelle Gregory, Jan A Kors, Automatic identification of relevant chemical compounds from patents, Database, Volume 2019, 2019
8.9 MiB
Lutz Weber, Matthias Irmer, Claudia Bobach: Understanding linguistic Markush expressions in chemical patents. ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. ACS 2017, 254
4.8 MiB
Lutz Weber: Classifying compounds in public databases. ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. ACS 2016, 251
1.8 MiB
Krallinger Martin, et al.: The CHEMDNER corpus of chemicals and drugs and its annotation principles. Journal of Cheminformatics. 2015;7
2.3 MiB
Irmer Matthias, Lutz Weber, Timo Böhme, Anett Püschel, Claudia Bobach, and Ulf Laube (2015): OCMiner for Patents. Extracting Chemical Information from Patent Texts. Proceedings of the Fifth BioCreative Challenge Evaluation Workshop, 119-123
187.4 KiB
Böhme, Timo, Matthias Irmer, Anett Püschel, Claudia Bobach, Ulf Laube and Lutz Weber (2014): OCMiner: Text processing, annotation and relation extraction for the Life Sciences. In Adrian Paschke, Albert Burger, Paolo Romano, M. Scott Marshall and Andrea Splendiani, editors: Proceedings of the 7th International Workshop on Semantic Web Applications and Tools for Life Sciences (SWAT4LS 2014), Berlin, Germany.
395.0 KiB
Schlaf, Antje, Claudia Bobach, and Matthias Irmer (2014): Creating a Gold Standard corpus for the extraction of chemistry-disease relations from patent texts. In Nicoletta Calzolari et al., editors: Proceedings of the Ninth International Conference on Language Resources and Evaluation (LREC'14), Reykjavik, Iceland. European Language Resources Association (ELRA).
185.1 KiB
Irmer, Matthias, Claudia Bobach, Timo Böhme, Ulf Laube, Anett Püschel and Lutz Weber (2013): Adapting the OCMiner text processing system to the CTD controlled vocabulary. In Cecilia Arighi et al., editors: Proceedings to the 4th BioCreative challenge evaluation workshop, volume 1, Bethesda, MD, USA, 114-117.
499.5 KiB
Irmer, Matthias, Claudia Bobach, Timo Böhme, Ulf Laube, Anett Püschel and Lutz Weber (2013): Chemical Named Entity Recognition with OCMiner. In Martin Krallinger et al., editor: Proceedings to the 4th BioCreative challenge evaluation workshop, volume 2, Bethesda, MD, USA, 42-96.
991.8 KiB
Eyrisch S, Girschick T, Ross G, Kalinski C, Khazak V, and Weber L. PriaXplore® - a novel technology platform for the identification of small molecule modulators of protein-protein interactions. Journal of Cheminformatics. 2013;5(Suppl 1):P35.
176.1 KiB
Bobach Claudia, Timo Böhme, Ulf Laube, Anett Püschel, and Lutz Weber (2012): Automated compound classification using a chemical ontology. Journal of Cheminformatics. 2012;4:40.
1.6 MiB
Aleksei Krasnov, Shadrack J. Barnabas, Timo Boehme, Stephen K. Boyerb and Lutz Weber: Comparing software tools for optical chemical structure recognition
1.3 MiB

Job Offers

Please be aware of the Informationen zum Datenschutz im Bewerbungsverfahren.

“Ontology Management Expert”

About us
We are Digital Science and we are advancing the research ecosystem.

We are a pioneering technology company, and our vision is of a future where a trusted and collaborative research ecosystem drives progress for all. We believe in better, open, collaborative and inclusive research. In creating the next generation of tools and working in partnership with the community we tackle some of the biggest challenges to research. In order to achieve our vision, we need innovative, inspiring and dynamic people to join our team. Do you want to join us in achieving our vision?

The OntoChem team is semantically processing more than 800 million documents in XML or PDF formats for customers like IBM, Google or pharma companies like Boehringer Ingelheim. OntoChem is using extremely large dictionaries to collect all life-science-related terms from structured sources and unstructured texts. These named entities and higher-level extracted knowledge provides the basis for our collaborations with Google and some of the most prestigious Life Science companies of the World – aiming to add value to people’s lives and to protect the environment.

Your new role

Your collaboration is required for the continuous maintenance and improvement of some of the world’s largest ontologies in the field of life and material sciences. These databases/ontologies are products of OntoChem and compiled from public sources as well as from proprietary input.
They require automatic improvements and also manual maintenance to ensure a high quality of our data. We increasingly use ML and LLMs in order to increase recall and precision of our named-entity recognition.

As our Ontology Management Expert, you will be part of our OntoChem ontology team. The ontology team adds value through creating, curating and supplying highly accurate ontological descriptions of mainly life-science-related fields for named-entity recognition pipelines and knowledge extraction workflows.

What you’ll be doing

  • You will find and assess new sources for concept information, design top-level hierarchies and define guidelines for creating ontologies.
  • Working with the OntoChem ontology team as well as with internal and external clients for custom projects.
  • Develop ontologies.
  • Manage ontologies.
  • Provide ontologies and solutions.
  • Liaise with and advise the other ontology builders, especially the more technical roles that create Java-based tools for creating ontologies. You will also work with frontend and backend as well as the product and technical support teams.

What you’ll bring to the role

  • You have a degree in protein chemistry, biochemistry, biology, bioinformatics or a similar course of study and are well acquainted with proteins and genes and/or diseases and/or chemistry.
  • Experience in pharma or related fields is a big plus.
  • Interest and/or experience in NLP and related fields (e.g. ontology formats (obo, owl, ttl, skos, rdf)) is a big plus.
  • An understanding of Java to support automated programmatic ontology building is a plus. Previous experiences with ontology/taxonomy/vocabulary building and/or named entity recognition  is a plus. A basic understanding of using regular expressions is a plus.
  • Commitment and reliability are a matter of course for you. In addition, you are characterised by a high degree of teamwork, flexibility and initiative.
  • Living within 2-3 hours of Germany’s time zone is a must since you will collaborate with an existing team.
  • English is mandatory as it is our main company language. Knowledge of German is a plus.
Not sure you meet all qualifications? Let us decide! Research shows that women and members of other under-represented groups tend to not apply to jobs when they think they may not meet every qualification, when in fact, they often do! We are committed to creating a diverse and inclusive environment and strongly encourage you to apply.

Our vision and values

We invest in, nurture and support innovative businesses and technologies that make all parts of the research process more open, efficient and effective.
The talent we secure is fundamental to us achieving our vision and our growth plans. The values we live by are:
We are brave in the pursuit of better
We are collaborative and inclusive
We are always open-minded

We are from and for the community

We’re an equal opportunity employer. All applicants will be considered for employment without attention to race, colour, religion, sex, sexual orientation, gender identity, national origin, veteran or disability status

About Digital Science

Digital Science is a technology company working to make research more efficient.

We invest in, nurture and support innovative businesses and technologies that make all parts of the research process more open and effective.

Our portfolio includes admired brands including Altmetric, Anywhere Access, Dimensions, Figshare, ReadCube, Symplectic, IFI Claims, GRID, Ripeta, Writefull, Gigantum and Overleaf.

We believe that together, we can help researchers make a difference.

Click the below link to apply

https://digitalscience.pinpointhq.com/en/postings/d7cd2be6-e0ee-45ca-889d-4e260e817b80/applications/new

“Allgemeine Geschäftsbedingungen” / “General Business Terms” of the
OntoChem GmbH

Download (PDF 0,2 MB)
the OntoChem GmbH AGBs (German)

Download (PDF 0,1 MB)
the Terms and Conditions of the OntoChem GmbH (English)

1. Geltung der allgemeinen Geschäftsbedingungen

Diese allgemeinen Geschäfts- und Lieferbedingungen gelten für alle zwischen der OntoChem GmbH (nachfolgend OntoChem genannt) und dem Käufer (nachfolgend Kunde genannt) abgeschlossenen Verträge sowie alle sonstigen Absprachen, die im Rahmen der Geschäftsverbindung getroffen werden. Die AGB gelten auch für alle künftigen Geschäftsbeziehungen mit demselben Kunden, ohne dass wir bei jedem einzelnen Vertrag wieder auf diese AGB hinweisen müssten. Allgemeine Geschäftsbedingungen des Kunden werden ausdrücklich nicht Vertragsinhalt, auch wenn ihnen seitens der OntoChem GmbH nicht ausdrücklich widersprochen wird. Für den Fall, dass der Kunde die nachfolgenden allgemeinen Geschäfts- und Lieferbedingungen nicht gelten lassen möchte, hat er dies vorher schriftlich der OntoChem anzuzeigen.

2. Angebote

Unsere Angebote sind frei bleibend und unverbindlich.

Die Bestellung der Ware durch den Kunden gilt als verbindliches Vertragsangebot, sofern sich aus der Bestellung oder den sonstigen Vereinbarungen nichts anderes ergibt. Auch Bestellungen per Email sind verbindlich. Wir sind berechtigt, dieses Vertragsangebot innerhalb von 2 Wochen nach Zugang bei uns anzunehmen. Die Annahme kann entweder schriftlich (z. B. durch Auftragsbestätigung) oder durch Auslieferung der Ware an den Kunden erklärt werden.

Sofern unsere Auftragsbestätigung Einzelheiten enthält, die von der Bestellung oder von unserer sonstigen Beauftragung abweichen, gelten diese Abweichungen als vom beauftragenden Unternehmen genehmigt, sofern dieses den Abweichungen nicht unverzüglich nach Erhalt der Auftragsbestätigung schriftlich widerspricht.

3. Leistungsumfang

Art und Umfang der von uns zu erbringenden vertraglich geschuldeten Leistungen sind in einer Leistungsbeschreibung aufgeführt. Die Leistungsbeschreibung ist im Angebot oder einem dem Angebot beigefügten Dokument enthalten. Der Kunde erhält mit der Entstehung oder Bearbeitung, soweit nichts anderes vereinbart und dies möglich ist, das nicht ausschließliche Recht, die gemäß Auftragsbestätigung oder Leistungsbeschreibung erbrachten Leistungen im dort genannten Umfang zu nutzen. Für Software gelten die Bestimmungen der Ziffer 11 dieser AGB. Unser Verfügungsrecht und sonstige Immaterialgüterrechte an von uns eingebrachten oder entwickelten Modellen, Methoden, Bausteinen u.Ä. bleibt unberührt.

Wir sind berechtigt, sämtliche Verpflichtungen gegenüber dem Kunden durch qualifizierte Erfüllungsgehilfen einschließlich Subunternehmern durchführen zu lassen. Dabei werden wir uns nur solcher Personen bedienen, deren Qualifikation ausreichend erscheint, die geschuldete Leistung ordnungsgemäß zu erbringen.

Für Änderungen oder Zusatzwünsche erstellt die OntoChem auf Wunsch des Kunden ein kostenpflichtiges Angebot. Bis zur Klärung der Zusatzleistungen kann die OntoChem die Arbeit am Projekt unterbrechen. Bei Ablehnung des Angebots für Zusatzleistungen durch den Kunden bleibt es beim ursprünglichen Leistungsumfang. Der Zeitplan verändert sich entsprechend der Prüf- und Angebotszeit.

4. Preise

Unsere Preise verstehen sich rein netto zzgl. der zum jeweiligen Abrechnungszeitpunkt gültigen Umsatzsteuer. Beim Versendungskauf trägt der Kunde die Transportkosten ab Werk und die Kosten einer ggf. vom Kunden gewünschten Transportversicherung. Etwaige Zölle, Gebühren, Steuern und sonstige öffentliche Abgaben trägt der Kunde.

Für die von uns zu erbringenden sonstigen Leistungen zahlt der Kunde die im Angebot einzeln aufgeführten Beträge. Der Kunde erstattet uns alle angemessenen Reisekosten und sonstigen Auslagen, die im Rahmen der Erbringung der Leistungen entstehen.

5. Zahlungsbedingungen

Sofern nicht in der Rechnung ein anderes Zahlungsziel gewährt wird, sind Rechnungen innerhalb von 10 Tagen ab Rechnungserhalt zu bezahlen. Mit Ablauf dieser Frist kommt der Kunde in Verzug.

Im Falle des Zahlungsverzuges ist die OntoChem berechtigt, Verzugszinsen in gesetzlicher Höhe zu berechnen.

Bei Zahlungsverzug ist die OntoChem berechtigt, die Erbringung weiterer Leistungen auch aus anderen Verträgen zu verweigern. Die Verpflichtung des Kunden zur Zahlung bleibt davon unberührt. Die OntoChem kann das Vertragsverhältnis fristlos kündigen, sofern der Kunde mit der Bezahlung eines nicht unerheblichen Teils einer Rechnung mehr als sechs Monate in Verzug ist.

Der Kunde hat der OntoChem unverzüglich mitzuteilen, wenn ein Insolvenzverfahren über sein Vermögen beantragt oder eröffnet wird oder er seine Zahlungen einstellt.

Sonstige Leistungen, die über einen längeren Zeitraum erbracht werden, werden dem Kunden im Voraus in Rechnung gestellt.

Zahlungen gelten als eingegangen, sobald wir über die Beträge verfügen können.

6. Zeitpunkt der Leistungserbringung / Lieferung

Die angegebenen Zeitpunkte der Leistungserbringung gelten nur als Schätzungen. Auch wenn Liefertermine verbindlich vereinbart wurden, kommen wir ohne Mahnung des Kunden nicht in Verzug.

Sofern wir Liefer- oder Leistungsfristen aus Gründen, die wir nicht zu vertreten haben, nicht einhalten können (Nichtverfügbarkeit der Leistung), werden wir den Kunden hierüber unverzüglich informieren und gleichzeitig eine angemessene, neue Liefer-/Leistungsfrist bestimmen. Ist die Leistung auch innerhalb der neuen Liefer-/Leistungsfrist nicht verfügbar, sind wir berechtigt, wegen des noch nicht erfüllten Teils ganz oder teilweise vom Vertrag zurückzutreten. Die gesetzlichen Rechte und Pflichten der Vertragsparteien bleiben unberührt.

Verlangt der Käufer nach Auftragserteilung Änderungen oder Ergänzungen des Auftrages oder treten sonstige Umstände ein, die der OntoChem eine Einhaltung des Liefertermins unmöglich machen, obwohl die OntoChem diese Umstände nicht zu vertreten hat, so verschiebt sich der Liefertermin um einen angemessenen Zeitraum.

Sofern sich der Kunde in Annahmeverzug befindet, wird der uns zustehende Anspruch auch dann fällig, wenn die Lieferung noch nicht erfolgt ist. Unsere weitergehenden Rechte bleiben unberührt.

7. Installation, Systemimplementierung

Eine Installation und/oder Systemimplementierung in den Räumlichkeiten des Kunden erfolgt nur, sofern dies ausdrücklich vereinbart wurde.

Bis zum Zeitpunkt der Lieferung hat der Kunde sämtliche für die Installation und/oder Systemimplementierung erforderlichen baulichen, technischen und sonstigen Voraussetzungen zu schaffen.

Führt der Kunde die entsprechenden Vorarbeiten nicht oder nicht rechtzeitig vor dem geplanten Liefer-/ Leistungstermin aus, so kommt er damit in Annahmeverzug. Wir werden dem Kunden sodann eine angemessene Nachfrist zur Bewirkung dieser Vorarbeiten setzen, nach deren Ablauf wir zum Rücktritt vom Vertrag berechtigt sind.

Die Arbeiten für die Installation und/oder Systemimplementierung beginnen mit der Lieferung, sofern nichts Abweichendes vereinbart ist. Sie werden in Abstimmung mit dem Kunden so koordiniert, dass die Beeinträchtigung des laufenden Geschäftsbetriebes des Kunden so gering wie möglich bleibt.

8. Abnahme durch den Kunden

Wir haben Anspruch auf die Abnahme der Produkte und ausgeführten Leistungen durch den Kunden. Für den Fall, dass die Parteien die Installation und/oder Systemimplementierung in den Räumlichkeiten des Kunden durch uns ausdrücklich vereinbart haben, werden wir im Rahmen der Abnahme durch einen Installationstest und/oder einen Probelauf die ordnungsgemäße Funktion der Produkte überprüfen. Den Ablauf des angewendeten Installationstests sowie die Dauer des Probelaufes liegen in unserem alleinigen Ermessen und sind von Produkt zu Produkt unterschiedlich.

Soweit Mängel festgestellt werden und der Installationstest nicht erfolgreich abgeschlossen werden kann gelten die Ziffern 14ff. Nach der Nacherfüllung ist der Abnahmetest auf unsere Kosten zu wiederholen. Zu diesem Zweck werden wir uns mit dem Kunden auf einen Termin einigen, der – unter Berücksichtigung aller Umstände – so bald wie möglich nach dem Zeitpunkt des erfolglosen Abnahmetests gelegen sein sollte.

Sofern keine Mängel festgestellt und der Installationstest erfolgreich durchgeführt wurde, sind der Bericht über das Ergebnis des Installationstests und das Datum von uns und vom Kunden zu unterzeichnen. Dieses Datum der Unterzeichnung gilt als Installationsdatum.

Der Probelauf beginnt mit dem Installationsdatum. Soweit die Produkte während des jeweiligen Probelaufes ohne jegliches Auftreten von Mängeln in Betrieb waren, ist der Kunde zur unverzüglichen Abnahme verpflichtet.

Soweit wir im Rahmen der zu erbringenden Leistung ausschließlich ein Konzept oder eine abnahmefähige sonstige Leistung erstellen, hat der Kunde unverzüglich schriftlich die Abnahme zu erklären, soweit die von uns erbrachte und dem Kunden zugänglich gemachte Leistung den vertraglichen Abmachungen entspricht.

Die Ablehnung der Abnahme eines Konzeptes oder einer abnahmefähigen sonstigen Leistung ist nur dann gültig, wenn sie zusammen mit einer schriftlichen Erklärung erfolgt, aus der die vom Kunden an dem Konzept oder der abnahmefähigen sonstigen Leistung festgestellten Mängel hervorgehen. Insoweit gelten die Ziffern 14ff.

Falls der Kunde das Konzept oder die abnahmefähige sonstige Leistung nutzt, ohne sie vollständig abgenommen zu haben, werden sich die Parteien gemeinsam über den Teil des Konzepts einigen, der genutzt wird; dabei stimmt der Kunde einer teilweisen Abnahme aufgrund dieser Vereinbarung zu. Der Kunde ist verpflichtet, die Annahme oder teilweise Annahme nicht unangemessen zu verweigern.

9. Stornierungen

Stornierungen von Bestellungen, die nicht auf der Mangelhaftigkeit der Waren oder Leistungen beruhen, können nur mit unserer Zustimmung erfolgen.

In diesen Fällen behalten wir uns das Recht vor, eine angemessene Stornogebühr zu erheben.

10. Eigentumsvorbehalt

Die gelieferte Ware bleibt bis zur vollständigen Bezahlung sämtlicher Forderungen der OntoChem aus der Geschäftsverbindung mit dem Kunden in Haupt- und Nebensache Eigentum der OntoChem.

Die unter Eigentumsvorbehalt stehenden Waren dürfen vor vollständiger Bezahlung der gesicherten Forderungen weder an Dritte veräußert, verpfändet, noch zur Sicherheit übereignet werden.

Bei vertragswidrigem Verhalten des Kunden, insbesondere bei Nichtzahlung des fälligen Preises, sind wir berechtigt, nach den gesetzlichen Vorschriften vom Vertrag zurückzutreten oder/und die Ware auf Grund des Eigentumsvorbehalts herauszuverlangen. Das Herausgabeverlangen beinhaltet nicht zugleich die Erklärung des Rücktritts; wir sind vielmehr berechtigt, lediglich die Ware herauszuverlangen und uns den Rücktritt vorzubehalten. Zahlt der Kunde den fälligen Preis nicht, dürfen wir diese Rechte nur geltend machen, wenn wir dem Kunden zuvor erfolglos eine angemessene Frist zur Zahlung gesetzt haben oder eine derartige Fristsetzung nach den gesetzlichen Vorschriften entbehrlich ist.

11. Software Lizenzen

Sofern Standardsoftware Gegenstand der von uns vertraglich geschuldeten Leistungen ist, darf von der gelieferten Standardsoftware nur in Übereinstimmung mit den Lizenzbedingungen des jeweiligen Herstellers der Software Gebrauch gemacht werden. Ein Nichtbefolgen dieser Lizenzbedingungen führt unter anderem zum Entzug der Lizenz.

Sofern Software, die nicht Standardsoftware ist, Gegenstand der vertraglich geschuldeten Leistungen ist, behalten wir uns vor, Art und Umfang der Nutzungsberechtigung in einer beizufügenden Leistungsbeschreibung festzuhalten.

Wird zu der Software ein separater Lizenzvertrag geschlossen, hebt dieser widersprechende Bestimmungen in den AGBs auf. Alle anderen Artikel behalten aber ihre Geltung.

12. Mitwirkungspflichten des Kunden

Der Kunde überlässt uns rechtzeitig und kostenlos alle technischen Daten, Computerprogramme, Akten, Dokumentationen, Prüfdaten und/oder andere Informationen und Hilfsmittel, die wir zur Erbringung der vertraglich geschuldeten Leistungen gemäß Leistungsbeschreibung für zweckdienlich, angemessen und notwendig erachten. Sollten sich Probleme, Verzögerungen, Schäden, Ansprüche oder Ausgaben, erst aus deren Inhalt, deren mangelhafter Genauigkeit, Unvollständigkeit oder Unrichtigkeit aller vom Kunden erbrachten Daten, Materialien und Informationen ergeben, gehen diese nicht zu unseren Lasten.

Kunde sichert der OntoChem zu, dass das übergebene Material frei von Patenten, Marken-, Urheber-, Lizenz- oder sonstigen Schutzrechten Dritter ist. Der Auftraggeber stellt diesbezüglich die OntoChem von allen Ansprüchen frei.

Sofern die vertraglich geschuldeten Leistungen von uns vor Ort in den Geschäftsräumen des Kunden erbracht werden, stellt dieser kostenlos diejenigen Büroräume, Dienstleistungen, Geräte (wie z.B. Computer, Internetanschluss und Kopierer) und gegebenenfalls auch Personal zur Verfügung, die wir angemessener Weise zur Durchführung der Leistungen benötigen. Soweit unsere Mitarbeiter oder Erfüllungsgehilfen in den Geschäftsräumen der Kunden eine Hausordnung zu beachten haben, wird der Kunde uns hiervon rechtzeitig in Kenntnis setzen und unsere Mitarbeiter/Erfüllungsgehilfen entsprechend einweisen.

Der Kunde hat vor der Durchführung der vertraglichen Leistungen durch die OntoChem eine Datensicherung der mit der Leistungserfüllung in Zusammenhang stehenden Daten durchzuführen. Der Auftraggeber ist verpflichtet, bis zum Ende der Gewährleistungspflicht bzw. der Vertragslaufzeit, seine Software und seine Daten ordnungsgemäß in regelmäßigen Abständen zu sichern. Als üblicher Schutz gilt derzeit ein Tag. Ferner ist der Auftraggeber verpflichtet, regelmäßig seine Daten einer Virenschutzprüfung zu unterziehen.

Der Kunde verpflichtet sich außerdem, sämtlichen sonstigen eventuell nach der Leistungsbeschreibung geltenden Mitwirkungspflichten nachzukommen.

Kommt der Kunde nicht oder nicht rechtzeitig vor dem geplanten Liefer-/Leistungstermin entsprechend der vorgenannten Absätze seinen Verpflichtungen nach, so kommt er damit in Annahmeverzug. Wir werden dem Kunden sodann eine angemessene Nachfrist zur Bewirkung dieser Mitwirkungsfristen setzen, nach deren Ablauf wir zum Rücktritt vom Vertrag berechtigt sind.

Im Falle eines durch die Anweisungen oder fehlenden Anweisungen des Kunden bedingten höheren Arbeitsanfalls muss der Kunde die verursachten Mehrkosten übernehmen.

13. Geistiges Eigentum

Sofern in der Leistungsbeschreibung keine anders lautende Bestimmung enthalten ist, sind wir alleiniger und ausschließlicher Eigentümer aller Designs, Verfahren, Techniken, Konzepte, Verbesserungen, Entdeckungen, Ideen und Erfindungen, unabhängig davon, ob diese patentfähig sind oder nicht, ob sie in Zusammenhang mit den Leistungen genutzt werden, hergestellt werden oder entstanden sind (zusammenfassend die „Schöpfungen“ genannt), und aller damit verbundener Patente, Urheberrechte, Geschäftsgeheimnisse und des gesamten sonstigen damit verbundenen geistigen Eigentums. Keine im Angebot, Leistungsbeschreibung, Auftragsbestätigung oder in einem sonstigen für die Vertragsbeziehung relevanten Dokument enthaltene Aussage ist dahingehend auszulegen, dass dem Kunden dadurch stillschweigend, durch schlüssiges Verhalten oder in sonstiger Weise eine Lizenz oder ein sonstiges Recht, ein Anspruch oder ein Anteil an den Schöpfungen und/oder dem damit verbundenen Eigentum übertragen wird, soweit dies nicht ausdrücklich dort beschrieben wird.

Der Kunde ist verpflichtet, uns in zumutbarer Weise bei der Abtretung, dem Nachweis, der Erlangung der Gültigkeit, der Eintragung und Durchsetzung unserer Rechte und unseres Eigentums an allen Patenten, Urheberrechten und dem sonstigen mit den Schöpfungen verbundenen geistigen Eigentum und aller sonstigen aufgrund des Vertragsverhältnisses in allen Ländern gewährten und von uns gehaltenen Rechten zu unterstützen. Dies umfasst u.a. auch die Ausfertigung von zusätzlichen Übertragungsurkunden und die Unterstützung bei Anmeldungen von Patenten, Urheberrechten oder Eintragungen von sonstigem geistigen Eigentum. Alle hiermit in Verbindung stehenden Kosten tragen wir.

14. Gewährleistung

Für die Rechte des Kunden bei Mängeln (Mängelansprüche) gelten die gesetzlichen Vorschriften, soweit im nachfolgenden nichts anderes bestimmt ist.

Ist die hergestellte Sache mangelhaft, kann der Kunde als Nacherfüllung zunächst Nachbesserung oder Neuherstellung nach den gesetzlichen Vorschriften verlangen. Unser Recht, die gewählte Art der Nacherfüllung unter den gesetzlichen Voraussetzungen zu verweigern, bleibt unberührt.

Als Vereinbarung über die Beschaffenheit der Ware gelten nur solche Produktbeschreibungen, die Gegenstand der Bestellung des Kunden sind.

Soweit die Beschaffenheit nicht vereinbart ist, haften wir gegenüber Unternehmern nicht für öffentliche Äußerungen (z.B. Werbeaussagen und Kennzeichnungen) Dritter, insbesondere nicht des Herstellers.

Ansprüche des Kunden auf Schadensersatz oder Ersatz vergeblicher Aufwendungen werden nur im Rahmen der nachfolgenden Ziffer 15 gewährt, im Übrigen sind sie ausgeschlossen.

Die Gewährleistung entfällt, sofern und sobald der Kunde Änderungen an der IT-Infrastruktur vornimmt oder an den gelieferten Produkten bzw. der damit zusammenhängenden Software ohne unsere ausdrückliche Zustimmung Änderungen vornimmt oder durch Personal vornehmen lässt, das hierzu nicht von uns ermächtigt wurde, es sei denn, der Kunde weist nach, dass die Mängel durch diese Arbeiten nicht verursacht wurden oder nicht auf die vorgenannten Maßnahmen zurückzuführen sind.

Sämtliche Informationen, Dokumente etc., die zur Durchsetzung von Ansprüchen gegen Dritte benötigt werden, haben die Parteien einander zur Verfügung zu stellen.

15. Haftung

Die OntoChem haftet für etwaige Schäden nur, falls sie eine vertragswesentliche Pflicht (Kardinalpflicht) schuldhaft in einer den Vertragszweck gefährdenden Weise verletzt oder der Schaden auf grobe Fahrlässigkeit oder Vorsatz der OntoChem zurückzuführen ist.

Sofern nicht Vorsatz oder grobe Fahrlässigkeit vorliegt, ist jede Haftung auf den bei Vertragsabschluss vorhersehbaren Schaden begrenzt sowie im Übrigen auch jede Haftung ausgeschlossen, gleich aus welchem Rechtsgrund. Insbesondere gilt der Ausschluss auch für Datenverluste, entgangenen Gewinn, sonstige Vermögensschäden, Mangelfolgeschäden und mittelbare Mangelfolgeschäden. Als Einschränkung dazu ist im Verkehr zwischen Unternehmern auch bei grobem Verschulden die Haftung begrenzt. Das gleiche gilt auch für Erfüllungsgehilfen oder gesetzliche Vertreter.

Wegen einer Pflichtverletzung, die nicht auf einem Mangel beruht, kann der Kunde – bei Vorliegen der weiteren gesetzlichen Voraussetzungen – nur zurücktreten, wenn wir die Pflichtverletzung zu vertreten haben. Der Rücktritt ist ausgeschlossen, wenn die Pflichtverletzung unerheblich ist.

Ansprüche des Kunden auf Schadenersatz verjähren spätestens in einem Jahr ab dem gesetzlichen Verjährungsbeginn. Dies gilt nicht für Schadenersatzansprüche, die aus einer vorsätzlichen Handlung, grob fahrlässigem Verhalten oder arglistiger Täuschung gegenüber der OntoChem begründet werden.

16. Finanzielle Verhältnisse

Sofern die finanziellen Verhältnisse des Kunden nach unserer freien Einschätzung die eingeräumten Zahlungsbedingungen nicht rechtfertigen, sind wir berechtigt, die noch nicht ausgeführten Bestellungen zurückzuhalten, bis der Kunde angemessene Sicherheiten geleistet hat. Dies gilt jedoch nicht, wenn der Kunde auf schriftliche Aufforderung hin sofort sämtliche bereits gelieferten Produkte bezahlt oder sämtliche bestellten, aber noch nicht gelieferten Produkte im Voraus bezahlt, oder nach unserer Wahl beides bezahlt.

17. Abtretung, Aufrechnung, Zurückbehaltung

Der Kunde hat ein Recht zur Aufrechnung nur, wenn seine Gegenansprüche rechtskräftig festgestellt oder von uns anerkannt wurden. Darüber hinaus kann der Kunde ein Zurückbehaltungsrecht nur ausüben, wenn dieses auf demselben Vertragsverhältnis beruht.

Die Abtretung von Rechten und Pflichten aus diesem Vertrag durch den Kunden bedarf der vorherigen schriftlichen Zustimmung durch uns.

18. Geheimhaltung

Jede der Vertragsparteien ist verpflichtet, die aus dem Bereich der jeweils anderen Vertragspartei stammenden Informationen und Dokumente, die als vertraulich gekennzeichnet sind oder aus anderen Gründen als Geschäfts- oder Betriebsgeheimnisse eindeutig erkennbar sind, geheim zu halten. Außer wenn dies zur Erreichung des Vertragszwecks erforderlich ist, sind die Vertragsparteien nicht berechtigt, solche Informationen oder Dokumente aufzuzeichnen, zu verwerten oder an Dritte weiterzugeben. Die Vertragsparteien haben ihren Arbeitnehmern und Vertretern entsprechende Verpflichtungen aufzuerlegen. Die Geheimhaltungsverpflichtung endet, falls die geheimhaltungsbedürftigen Informationen allgemein bekannt werden oder während der Dauer der Geheimhaltungspflicht dem Anwender von dritter Stelle ohne Auferlegung einer Geheimhaltungspflicht bekannt werden.

Der Auftraggeber gestattet dem Auftragnehmer, alle zur Auftragsabwicklung notwendigen Daten elektronisch zu verarbeiten und zu speichern.

19. Erfüllungsort, Gerichtsstand und anwendbares Recht

Für diese AGB und alle Rechtsbeziehungen zwischen uns und dem Kunden gilt das Recht der Bundesrepublik Deutschland. Soweit für Auslandskunden das ins deutsche Recht übernommene UN-Kaufrecht anzuwenden wäre, wird dieses ausgeschlossen.

Ist der Kunde Kaufmann im Sinne des Handelsgesetzbuchs, juristische Person des öffentlichen Rechts oder ein öffentlich-rechtliches Sondervermögen, ist ausschließlicher Gerichtsstand für alle sich aus dem Vertragsverhältnis unmittelbar oder mittelbar ergebenden Streitigkeiten Halle/Saale. Dasselbe gilt, wenn der Kunde keinen allgemeinen Gerichtsstand in Deutschland hat oder Wohnsitz oder gewöhnlicher Aufenthalt zum Zeitpunkt der Klageerhebung unbekannt sind.

20. Schlussbestimmungen

Die Nichtigkeit oder Unwirksamkeit einzelner Bestimmungen dieses Vertrages berührt nicht die Gültigkeit der übrigen Bestimmungen. Im Fall der Unwirksamkeit einer Bestimmung sind die Parteien verpflichtet, die mangelhafte Bestimmung durch eine wirksame zu ersetzen, deren wirtschaftlicher und rechtlicher Sinn dem der mangelhaften Bestimmung am nächsten kommt.

Änderungen oder Ergänzungen dieses Vertrages bedürfen der Schriftform.

Stand: März 2017

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